Frank de Boer won vele prijzen zoals de UEFA Cup, Champions League, Wereldbeker en Europese Super Cup. In 2006 zette hij een punt achter zijn carrière en begon hij als trainer. Hij is de tweelingbroer van Roland de Boer.

De Boer begon zijn professionele voetbalcarrière bij Ajax in 1988. Hier debuteerde hij op 21 september 1988. Bij Ajax won hij bijna alle prijzen, (Champions League 1995, UEFA Cup 1992) ook werden ze vijf keer landskampioen en wonnen ze twee keer de KNVB-beker. De Boer speelde tot 1999 bij Ajax, daarna ging hij samen met zijn broer naar FC Barcelona. Hier bleef hij tot 2003, hij vertrok naar Galatasaray.

Hierna heeft hij nog gespeeld bij respectiefelijk Glasgow Ranger, Al-Rayyan en Al-Shamal.  

Samen met Cor Veldhoen, Ruud Krol, Adri van Tiggelen en Kees Kuijs wordt Frank de Boer gerekend tot de beste Nederlandse linksbacks aller tijden.